二者都是采取全日制攻讀的方式，其區(qū)別主要有兩點：

培養(yǎng)目標不同。專業(yè)學位是培養(yǎng)在某一專業(yè)（或職業(yè)）領(lǐng)域具有堅實的基礎(chǔ)理論和寬廣的專業(yè)知識，具有較強的解決實際問題的能力，能夠承擔專業(yè)技術(shù)或管理工作，具有良好職業(yè)素養(yǎng)的高層次應用型專門人才。學術(shù)性學位碩士研究生則主要是培養(yǎng)學術(shù)研究人才。

培養(yǎng)方式不同。專業(yè)學位課程設(shè)置以實際應用為導向，以職業(yè)需求為目標，以綜合素養(yǎng)和應用知識與能力的提高為核心。教學內(nèi)容強調(diào)理論性與應用性課程的有機結(jié)合，突出案例分析和實踐研究；教學過程重視運用團隊學習、案例分析、現(xiàn)場研究、模擬訓練等方法；注重培養(yǎng)學生研究實踐問題的意識和能力。在具體的學習過程中，要求有為期至少半年（應屆本科畢業(yè)生實踐教學時間原則上不少于1年）的實踐環(huán)節(jié)。而學術(shù)學位研究生的課程設(shè)置側(cè)重于加強基礎(chǔ)理論的學習，重點培養(yǎng)學生從事科學研究創(chuàng)新工作的能力和素質(zhì)。